Уважаемые участники!

Практикум Школы будет проходить на собственных ноутбуках участников. Для работы потребуется установить 4 программы, специальная настройка которых не требуется. Достаточно скачать последнюю версию для вашей платформы (64- или 32-битную)

1) AutoDock Vina (молекулярный докинг) http://vina.scripps.edu/download.html. Для Ubuntu может быть установлена из репозитория: https://launchpad.net/ubuntu/+source/autodock-vina

2) AutoDock Tools http://mgltools.scripps.edu/downloads

3) UCSF Chimera https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/download.html

4) Discovery Studio Visualizer Client - страница загрузки на официальном сайте http://www.3dsbiovia.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/visualization-download.php

Если возникнут трудности с загрузкой Visualizer Client, подготовлен дистрибутив, который скачан ранее: https://yadi.sk/d/_fiV8TcuIVIikw

В рамках первого дня планируется проверить работоспособность ПО участников. На флешке в аудитории будут дистрибутивы на случай, если не удалось установить программы заранее.

Статьи, исходные файлы и программы будут собраны в папке https://yadi.sk/d/OnKV57Rvie9CjQ

Темы занятий:

1. Визуализация белков и белковых комплексов
2. Визуализация данных моделирования
3. Докинг малых молекул к сайтам связывания белков

Преподаватель школы:

доцент ИГУ Петрушин Иван Сергеевич

e-mail ivan.kiel@gmail.com

в контакте vk.com/ispetrushin